Nein, die SD-Karte kann nicht kaputt gehen, wenn man etwas falsch installiert.
Solange du die SD-Karte nicht physisch mit Gewalt beschädigst, kann da nichts kaputt gehen

Du solltest aber den Pi2 mit recalboxOS niemals einfach so vom Strom trennen, sondern immer schön vom Menü aus herunterfahren.
Ansonsten kann es nämlich dazu kommen, dass das Datei-System zerschossen wird, was dazu führt, dass der Pi nicht mehr bootet, oder ständig abstürzt oder andere Probleme (da hilft dann nur ein Löschen und neu Bespielen der SD-Karte).